基于線粒體COI序列的中國(guó)沿海鲀形目魚類DNA條形碼研究.pdf

1、暨南大學(xué)碩士學(xué)位論文題名（中英對(duì)照）：基于線粒體基于線粒體COI序列的中國(guó)沿海鲀形目魚類序列的中國(guó)沿海鲀形目魚類DNA條形碼研究條形碼研究DNAbarcodingofTetraodontifmesincoastalwatersofChina作者姓名：郜星晨指導(dǎo)教師姓名及學(xué)位、職稱：章群博士副教授學(xué)科、專業(yè)名稱:生物學(xué)微生物學(xué)學(xué)位類型：科學(xué)學(xué)位論文提交日期：2015年5月25日論文答辯日期：2015年6月5日答辯委員會(huì)主席：論文評(píng)閱人：學(xué)

2、位授予單位和日期：I基于線粒體基于線粒體COI序列的中國(guó)沿海鲀形目魚類序列的中國(guó)沿海鲀形目魚類DNA條形碼研究條形碼研究中文摘要中文摘要鲀形目（Tetraodontifmes）現(xiàn)存10科100屬約350種主要分布在熱帶和亞熱帶海洋，僅少數(shù)種類定居在淡水中，或在一定季節(jié)進(jìn)入江河。鲀形目很多種類是重要的養(yǎng)殖魚類和海洋捕撈對(duì)象，其中綠鰭?cǎi)R面鲀（Thamnaconusmodestus）、黃鰭?cǎi)R面鲀（T.hypargyreus）等目前面臨資源枯竭

3、的困境。東方鲀屬（Takifugu）魚類近年來(lái)在水產(chǎn)養(yǎng)殖、河豚毒素醫(yī)藥開發(fā)、脊椎動(dòng)物基因組研究方面有著廣泛的應(yīng)用，具有重要的經(jīng)濟(jì)地位、科研及醫(yī)藥價(jià)值，與此同時(shí)誤食河鲀引起的中毒乃至死亡事件也時(shí)有發(fā)生。準(zhǔn)確的物種鑒定不僅能有效地區(qū)分鲀毒魚類，而且可以促進(jìn)漁業(yè)資源合理開發(fā)、生態(tài)調(diào)查及生物多樣性保護(hù)。但由于鲀形目魚類外部形態(tài)總體差異較大，近緣種間十分相似，傳統(tǒng)分類學(xué)多以條紋、斑點(diǎn)、體色等易受主觀因素影響的形態(tài)特征作為主要辨別依據(jù)，以致至今鲀形

4、目魚類分類一直存在爭(zhēng)議。DNA條形碼通過(guò)對(duì)標(biāo)準(zhǔn)基因DNA序列的分析快速鑒定物種，已成功應(yīng)用于動(dòng)物、植物及微生物。本文測(cè)定了中國(guó)沿海8科19屬33種110尾鲀形目魚類線粒體COI基因5’端652bp的序列，結(jié)合GenBank下載的序列，共分析了8科25屬56種210條魚類COI序列，旨在利用DNA條形碼技術(shù)鑒定我國(guó)沿海常見的鲀形目魚類，澄清目前分類的混亂，揭示可能存在的隱存種，并進(jìn)行初步的系統(tǒng)發(fā)育分析，基于K2P替代模型的研究結(jié)果如下：（

5、1）鲀形目亞目?jī)?nèi)科間、科內(nèi)屬間、屬內(nèi)種間、種內(nèi)平均遺傳距離分別為20.38%（18.59%27.04%）、16.57%（0.89%22.74%）、7.35%（0.03%17.09%）、0.56%（05.41%），其中53種種內(nèi)遺傳距離小于2%的遺傳距離閾值，48種種內(nèi)遺傳距離小于1%。56種魚類種間平均遺傳距離約為種內(nèi)遺傳距離的34倍，51種魚類最小種間遺傳距離大于最大種內(nèi)遺傳距離，在種內(nèi)、種間乃至屬間均無(wú)重疊，形成理想的DNA條形碼間

6、隙。但東方鲀屬的魚類可能受到種間雜交、近期輻射進(jìn)化等干擾，墨綠東方鲀（T.basilevskianus）與紅鰭東方鲀（T.rubripes）、雙斑東方鲀（T.bimaculatus）與黃鰭東方鲀（T.xanthopterus）等未形成明顯的DNA條形碼間隙；而兔頭鲀屬（Lagocephalus）魚類種間遺傳距離已經(jīng)達(dá)到鲀形目魚類屬間平均水平（16.57%），分類地位需要進(jìn)一步研究。（2）在鄰接樹上鲀形目魚類總體按物種名聚類，與形態(tài)學(xué)鑒定