淀粉纖維蛋白錯(cuò)誤折疊機(jī)理的理論研究.pdf

1、淀粉纖維在退行性疾病中扮演著重要的角色，包括老年癡呆癥，II型糖尿病，海綿狀腦組織病，以及阮病毒引起的疾病等。相關(guān)蛋白的錯(cuò)誤折疊將導(dǎo)致淀粉纖維。而目前關(guān)于這些纖維的形成機(jī)制仍然不是非常清楚。
　　本論文利用分子動(dòng)力學(xué)模擬（MD）手段分析了八類六肽的六聚體的穩(wěn)定性，尋找淀粉纖維聚集的關(guān)鍵因素。MD的結(jié)果顯示，八類六聚體中VEALYL和MVGGVV-1的穩(wěn)定性是最高的，然后是SNQNNY，以及LYQLEN, MVGGVV-2, VQI

2、VYK, SSTSAA, GGVVIA。統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)顯示，疏水性氨基酸殘基對于穩(wěn)定六聚體內(nèi)部zipper結(jié)構(gòu)起著重要的作用。MVGGVV-1的單點(diǎn)突變和雙突變實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)1號Met與2號Val是重要的疏水殘基，這與之前的統(tǒng)計(jì)分析的結(jié)果是一致的。MVGGVV-1的各種低聚體的穩(wěn)定性分析表明，其成纖維的中間狀態(tài)結(jié)構(gòu)可能是三聚體（3-0）或者四聚體（2-2）的形式。
　　我們還對比較穩(wěn)定的VEALYL進(jìn)行了單點(diǎn)突變和雙突變實(shí)驗(yàn)研究，證實(shí)了一號