日本沼蝦不同地理群體遺傳多樣性與分子標(biāo)記鑒別研究.pdf

1、日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)自然分布于中國、日本、越南以及緬甸等地區(qū)，廣泛分布于我國各地淡水水域。這一物種資源量在長江中下游地區(qū)是非常豐富的，特別是太湖地區(qū)。該品種在中國和日本是重要的淡水經(jīng)濟(jì)蝦類。近年來，由于過度捕撈，自然棲息地的退化使得日本沼蝦野生群體的種群遺傳結(jié)構(gòu)和資源量急劇下降。因而開展遺傳多樣性分布和野生群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究對制定保護(hù)措施顯得尤為重要。
　　利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對江蘇長江

2、和太湖2個(gè)地區(qū)日本沼蝦群體的遺傳多樣性進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示：75個(gè)ISSR引物中有6個(gè)引物能擴(kuò)增出清晰條帶，6個(gè)引物對兩個(gè)群體各24個(gè)樣品擴(kuò)增出34個(gè)位點(diǎn)。日本沼蝦長江和太湖兩群體的多態(tài)位點(diǎn)比率為76.47％和73.53％，Shannon’s指數(shù)分別為0.3480和0.3465，Shannon's指數(shù)估算和AMOVA分析均顯示日本沼蝦的遺傳變異主要來自于群體內(nèi)個(gè)體間。日本沼蝦UPGMA系統(tǒng)樹基本依據(jù)不同群體分別聚類，表現(xiàn)出一定的遺傳趨異

3、。結(jié)果表明：兩個(gè)地區(qū)日本沼蝦群體的遺傳多樣性處于較高水平：日本沼蝦江蘇地區(qū)長江和太湖兩個(gè)群體間存在一定的遺傳分化。
　　采用AFLP技術(shù)分別對太湖、長江日本沼蝦群體各30尾的基因組DNA進(jìn)行了群體特異性位點(diǎn)比對分析，并對各位點(diǎn)基因頻率分布進(jìn)行正態(tài)性檢驗(yàn)、方差齊性檢驗(yàn)(F檢驗(yàn))、樣本平均數(shù)差異顯著性檢驗(yàn)(t檢驗(yàn))。結(jié)果顯示：3對引物共擴(kuò)增出138個(gè)位點(diǎn)；太湖組是獨(dú)立于長江組的群體，而且它們是兩個(gè)分化了的野生群體；采用變異性的顯著性檢

4、驗(yàn)(x2檢驗(yàn))對位點(diǎn)進(jìn)行差異比較發(fā)現(xiàn)，23個(gè)位點(diǎn)在太湖組中出現(xiàn)的頻率顯著高于長江組，其中位點(diǎn)BY160、BY320、BY470、BY520是與太湖群體分化顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，可作為區(qū)別太湖野生群體與長江野生群體的標(biāo)記。
　　對我國江蘇省4水域日本沼蝦40個(gè)野生個(gè)體的線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基I(COI)部分序列進(jìn)行了測定和分析。經(jīng)比對獲得640bp核苷酸片段，發(fā)現(xiàn)36個(gè)變異位點(diǎn)，得到19個(gè)單倍型，包括4個(gè)共享單倍型，各群體都具有較好的單