膠質(zhì)母細胞瘤中離子通道的預后價值及KCNB1影響自噬的研究.pdf

1、第一部分基于RNA測序數(shù)據(jù)的3個離子通道基因組成的危險評分在原發(fā)性膠質(zhì)母細胞瘤的預后價值
　　背景:
　　近年來研究表明，離子通道基因在膠質(zhì)瘤的進展中起著重要作用。本研究目的在于應用RNA測序數(shù)據(jù)篩選出能夠預測原發(fā)性膠質(zhì)母細胞瘤(pGBM)預后的基于離子通道基因的危險評分。
　　方法:
　　通過單變量COX及t檢驗在中國腦膠質(zhì)瘤大樣本庫(CGGA)各個級別的膠質(zhì)瘤中鑒定出3個與預后和級別相關的離子通道基因，并基于

2、這3個基因構(gòu)建危險評分，賦予每個pGBM患者一個評分。根據(jù)評分中位值，將83例pGBM患者分成高危險評分組(n=42)和低危險評分組(n=41)。并利用基因功能分析(GO，Gene ontology)及基因富集分析(GSEA，Gene Set EnrichmentAnalysis)進一步研究危險評分相關的生物學功能。這些結(jié)果均在另外兩個數(shù)據(jù)庫中進行驗證(TCGA和REMBRANDT)。
　　結(jié)果:
　　我們篩選出3個與膠質(zhì)瘤

3、預后及級別相關的離子通道基因（KCNN4、KCNB1和KCNJ10），并且構(gòu)建了基于這3個基因表達值的危險評分。生存分析發(fā)現(xiàn)相比較低危險評分組，高危險評分組患者預后要差，對化療反應敏感，且COX多元回歸分析證實此危險評分是一個獨立的預后預測因子。亞型分析顯示高危險評分組傾向于膠質(zhì)瘤Mesenchymal型和IDH1野生型。GO分析顯示高危險評分組傾向于凋亡和血管生成等功能。GSEA分析發(fā)現(xiàn)高危險評分組傾向于細胞增殖和運動行為等功能。以上

4、結(jié)果均在另外兩個數(shù)據(jù)庫中得到驗證(TCGA和REMBRANDT)。
　　結(jié)論:
　　這個危險評分系統(tǒng)能更好的預測pGBM患者的預后，并有助于膠質(zhì)瘤患者的個體化治療。
　　第二部分電壓門控性鉀離子通道KCNB1對膠質(zhì)瘤預后的影響及自噬機制研究
　　背景:
　　第一部分研究發(fā)現(xiàn)KCNB1與膠質(zhì)瘤級別及預后相關，本課題進一步研究KCNB1影響膠質(zhì)瘤進展的分子機制。
　　方法:
　　本研究收集42例膠質(zhì)

5、瘤獨立標本進行qRT-PCR驗證，并收集41例Ⅲ級，83例Ⅳ級膠質(zhì)瘤標本進行Kaplan-Meier生存分析。整合系統(tǒng)生物學預測KCNB1的功能，然后采用免疫印跡、免疫熒光、流式細胞術(shù)、MTT等技術(shù)，通過體內(nèi)外實驗去驗證。
　　結(jié)果:
　　qRT-PCR驗證KCNB1表達與級別呈負相關，且生存分析表明KCNB1高表達組有較好的總生存期及無瘤生存期。生物學分析及實驗證實KCNB1具有促進自噬、凋亡，抑制增殖、侵襲功能。KCNB