基于葉綠體序列rpl16的中國(guó)櫻桃居群遺傳多樣性及居群遺傳結(jié)構(gòu)研究.pdf

1、中國(guó)櫻桃（Cerasus pseudocerasus Lindl.）是起源于我國(guó)的落葉果樹(shù)，它隸屬于薔薇科(Rosaceae)李亞科(Prunoideae)櫻屬（Cerasus），約有3000余年的栽培歷史，其早熟性、觀賞性賦予了它很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。中國(guó)櫻桃在我國(guó)有著廣闊的分布，在川、云、陜、貴分布著其豐富的野生資源，河南、安徽、四川、貴州、甘肅、重慶等省市分布著中國(guó)櫻桃的重要栽培種質(zhì)，但是目前關(guān)于中國(guó)櫻桃野生及栽培資源的遺傳背景還了解得

2、不夠全面、深入，影響了對(duì)中國(guó)櫻桃優(yōu)良種質(zhì)的保護(hù)和利用。鑒于此，本文采集了來(lái)自四川、安徽、河南、陜西、貴州、重慶等省市的263份中國(guó)櫻桃材料，包括9個(gè)中國(guó)櫻桃野生群體和8個(gè)中國(guó)櫻桃栽培群體，基于葉綠體序列rpl16內(nèi)含子區(qū)，展開(kāi)了對(duì)中國(guó)櫻桃資源的遺傳多樣性評(píng)價(jià)和居群遺傳結(jié)構(gòu)分析，其結(jié)果如下:
　　1.中國(guó)櫻桃資源遺傳多樣性評(píng)價(jià)。17個(gè)群體的263個(gè)體的葉綠體片段序列遺傳多樣性研究結(jié)果表明:1)263條rpl16內(nèi)含子區(qū)序列共檢測(cè)到1

3、4個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，所有17個(gè)群體共檢測(cè)到22個(gè)葉綠體單倍型。單倍型多態(tài)性(Hd)分布范圍為0.000-0.879，總?cè)后w的單倍型多態(tài)性(Hd)為0.689。核苷酸多樣性（π）分布范圍為0.00000-0.00316，，總?cè)后w的核苷酸多樣性(π)為0.00184。2）不同群體類(lèi)型之間的遺傳多樣性水平相差較大，其中野生群體擁有較高的遺傳多樣性水平，其平均單倍型多樣性Hd=0.776，核苷酸多樣性π=0.00258，而栽培群體的平均單倍型多樣性

4、水平Hd=0.575，核苷酸多樣性π=0.00076。中國(guó)櫻桃桃具有豐富的遺傳多樣性，這一結(jié)果與大多數(shù)研究結(jié)果是一致的，而栽培群體較低水平的遺傳多樣性形成的原因可能是由于長(zhǎng)期的馴化栽培及無(wú)性繁殖引起的嚴(yán)重的瓶頸效應(yīng)使得其有效群體大小嚴(yán)重減小所導(dǎo)致的。
　　2.中國(guó)櫻桃的群體遺傳結(jié)構(gòu)。群體遺傳結(jié)構(gòu)研究結(jié)果表明:1）兩兩群體間遺傳分化結(jié)果顯示:17個(gè)中國(guó)櫻桃群體兩兩群體間的遺傳分化系數(shù)Fst的變化范圍為0.0000～0.8912，除野

5、生貴陽(yáng)群體、野生青川群體、野生商南群體與各栽培群體間的遺傳分化系數(shù)較大，其余群體間遺傳分化系數(shù)相對(duì)較小，兩兩群體間遺傳分化不明顯;野生群體與栽培群體間的遺傳分化系數(shù)Fst=0.1558(P=0.0000)，雖然少數(shù)幾個(gè)野生群體與栽培群體間有較為明顯的遺傳分化，但在總體上看野生群體與栽培群體之間的遺傳分化并不明顯。2）分子差異分析(AMOVA)結(jié)果表明:中國(guó)櫻桃總?cè)后w與栽培群體的遺傳變異主要來(lái)源于群體內(nèi)，而栽培群體的遺傳變異有65.57％

6、來(lái)源于群體間，34.43％來(lái)源于群體內(nèi)。3）基于K-2P模型的遺傳距離結(jié)果顯示，17個(gè)群體兩兩之間的遺傳距離變化范圍為0.000～0.004，野生商南群體與其余群體的遺傳距離最遠(yuǎn)?；贙-2P模型遺傳距離的聚類(lèi)分析中17個(gè)中國(guó)櫻桃群體主要被聚為兩個(gè)大支，野生青川群體與野生商南群體被聚為一支(Ⅱ)，其余群體被聚為另一支(Ⅰ)，說(shuō)明野生青川群體與野生商南群體與其余群體遺傳距離較遠(yuǎn)。單倍型的NJ聚類(lèi)圖與單倍型的網(wǎng)絡(luò)圖是單倍型關(guān)系結(jié)果的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)

7、，表明:22個(gè)單倍型分為了兩個(gè)大的分支A和B，A、B分枝分別包含了13和9個(gè)單倍型，大分枝A分為了A1和A2兩個(gè)亞枝，大分枝B分為了B1和B2兩個(gè)亞支。單倍型Hap1與Hap2是分布最廣的兩個(gè)單倍型，且有較高的頻率。4）中性檢驗(yàn)與錯(cuò)配分析結(jié)果顯示:栽培群體的Tajiama's D為顯著的負(fù)值，且其錯(cuò)配分布曲線是一個(gè)峰曲線，說(shuō)明栽培群體是一個(gè)不穩(wěn)定群體，其偏離了中性進(jìn)化，近期經(jīng)歷過(guò)大規(guī)模的群體擴(kuò)張。由以上研究結(jié)果推知:中國(guó)櫻桃的繁育系統(tǒng)與