多重耐藥鮑曼不動桿菌基因組多態(tài)性及耐藥基因組的研究.pdf

1、目的：多重耐藥鮑曼不動桿菌是引起醫(yī)院感染的重要條件致病菌,給院內(nèi)感染防控和治療提出了嚴峻的挑戰(zhàn)。本文報道了多重耐藥鮑曼不動桿菌臨床分離株的基因組多態(tài)性,以及代表性流行克隆株AB07104、AB0868和AB0715的全基因組序列,并進行耐藥基因組的初步分析。
　　 方法：采用多重PCR方法快速鑒定多重耐藥鮑曼不動桿菌；分別應(yīng)用DiversiLab微生物基因組分型系統(tǒng)、基于序列型多重PCR方法和MLST分型技術(shù)對194株多重耐藥鮑

2、曼不動桿菌的分子流行特征進行分析,將上述3種基因分型技術(shù)進行合理組合,建立了多重耐藥鮑曼不動桿菌的分子溯源系統(tǒng)；利用在線細菌基因組注釋系統(tǒng)BASys對3株菌(AB07104、AB0868和AB0715)的全基因組序列進行注釋,確定了編碼基因,在此基礎(chǔ)上,綜合利用相關(guān)的分子生物信息學(xué)分析軟件,在全基因組水平掃描所有與耐藥相關(guān)的基因元件,從耐藥基因組的角度探討了鮑曼不動桿菌多重耐藥性的形成機制。
　　 結(jié)果：194菌株中均攜帶有bl

3、aOXA-51-like基因,對鮑曼不動桿菌的鑒定率為100％,全部實驗菌株具有9種耐藥基因組合,其中以blaOXA-51-like+blaOXA-23-like+intⅠ組合為主(n=139,71.65％),而blaOXA-23-like、blaOXA-24-like、blaOXA-58-like和intⅠ的檢出率分別為76.29％、1.55％、1.55％和89.18％；多重耐藥鮑曼不動桿菌主要流行克隆株MLST的等位基因譜為ST2(

4、2-2-2-2-2-2-2),與英國流行克隆OXA-23 clone1也具有相同的MLST等位基因譜,研究還發(fā)現(xiàn)了一個新的攜帶blaOXA-58-like基因的多重耐藥鮑曼不動桿菌流行克隆ST23(Institute Pastuer MLSTScheme)/ST91(Bartual et al.MLST Scheme);多重耐藥鮑曼不動桿菌全基因組具有非常豐富的插入序列ISAbal,位于blaOXA-23-like、ampC、sulⅡ等

5、耐藥基因的上游,blaOXA-23-like基因的轉(zhuǎn)移載體為Tn2008;耐藥基因組不僅包含有豐富的特異性耐藥相關(guān)基因,同時也具有多拷貝的外排泵編碼基因、多重耐藥蛋白編碼基因、重金屬抗性相關(guān)基因、外膜蛋白編碼基因等,另外,還發(fā)現(xiàn)3株菌gyrA(Ser83Leu)和parC(Ser80Ile)基因的QRDR發(fā)生了突變,但未發(fā)現(xiàn)具有典型結(jié)構(gòu)的“AbaR型耐藥島”。
　　 結(jié)論：本研究解決了醫(yī)院感染監(jiān)測中多重耐藥鮑曼不動桿菌的快速鑒定