豬瘟病毒JL-1(06)株的分離鑒定及其全基因組序列分析.pdf

1、豬瘟（classicalswinefever，CSF）是由豬瘟病毒（classicalswinefever virus，CSFV）引起豬的一種以稽留高熱、廣泛出血和高死亡率為主要特征的高度接觸性傳染病。CSFV是黃病毒科（Flaviviridae）瘟病毒屬（Pestivirus）的成員，該屬還有牛病毒性腹瀉病毒1型（Bovineviraldiarrheavirustype1，BVDV-1）、牛病毒性腹瀉病毒2型（BVDV-2）、綿羊邊界

2、病病毒（Borderdisease virus，BDV）、長(zhǎng)頸鹿瘟病毒（Pestivirus of Giraffe）（暫定種）和非典型瘟病毒（D32/00_‘HoBi’）。CSFV為單股正鏈RNA病毒，基因組長(zhǎng)約12.3kb，兩側(cè)為高度保守的5′和3′非編碼區(qū)（UTR），中間含一個(gè)大的開放閱讀框（ORF），編碼4種結(jié)構(gòu)蛋白（C、E1、E2和Erns）和7種非結(jié)構(gòu)蛋白（Npro、p7、NS2-3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B）。

3、
　　本研究用 PK15細(xì)胞從吉林某豬場(chǎng)疑似急性豬瘟仔豬的脾臟中分離出一株豬瘟病毒，命名為JL-1(06)株。參照已發(fā)表的豬瘟病毒基因組序列設(shè)計(jì)了9對(duì)引物，提取JL-1(06)株RNA，用RT-PCR擴(kuò)增得到了覆蓋JL-1(06)基因組全長(zhǎng)的9個(gè)cDNA片段，將所得cDNA片段分別克隆至pMD18-T載體中，經(jīng)測(cè)序和拼接后，獲得了JL-1(06)株基因組全序列。經(jīng)測(cè)定，JL-1(06)基因組全長(zhǎng)12298bp，含有1個(gè)大的ORF，

4、編碼一個(gè)由3898個(gè)氨基酸殘基組成的多聚蛋白，其5?-UTR和3?-UTR分別由373bp和231bp組成。
　　將JL-1(06)株與國(guó)內(nèi)外已發(fā)表的CSFV毒株全基因組序列進(jìn)行比較，結(jié)果表明，JL-1(06)株與石門系毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性均在99.4％以上，與Eystrup、ALD、Alfort/187、Alfort A19、CAP、Glentorf、GPE?、cF114和SWH株的核苷酸和氨基酸同源性在97%以上；與