山羊Agouti基因與毛色表型相關(guān)分析及其遺傳變異的研究.pdf

1、本試驗(yàn)根據(jù)GenBank上已發(fā)表的牛(X99691)、豬(AJ427478)馬(AF288358)和人的Agouti因序列設(shè)計(jì)引物，擴(kuò)增山羊Agouti基因外顯子1和內(nèi)含子1的部分序列片斷，內(nèi)含子1的部分序列與本實(shí)驗(yàn)室之前測(cè)得的山羊Agouti基因序列片斷(GenBank序列號(hào):EF587236)進(jìn)行拼接，得到5270bp長(zhǎng)度的山羊Agouti基因序列。比對(duì)分析我們得到的序列，又發(fā)現(xiàn)了2個(gè)SNPs，再對(duì)編碼區(qū)外顯子4的唯一SNP位點(diǎn)進(jìn)行

2、分析，根據(jù)拼接結(jié)果命名這些突變位點(diǎn)，分別為399C>T、128delT和5701G>T。其中，5701.G>T的突變引起了山羊Agouti信號(hào)蛋白125位上氨基酸的改變(甘氨酸→纈氨酸)。本試驗(yàn)僅選取128delT和5701G>T兩個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行研究。 本研究利用PCR-RFLP技術(shù)對(duì)9個(gè)中國(guó)地方山羊品種，總共545個(gè)樣品的山羊Agouti基因5701G>T位點(diǎn)進(jìn)行研究。在5701G>T位點(diǎn)上檢測(cè)到2個(gè)等位基因，存在3種基因型:TT

3、、TG和GG。其中，T等位基因在被檢測(cè)的大多數(shù)山羊品種中是優(yōu)勢(shì)等位基因，再結(jié)合相應(yīng)山羊品種的毛色表型進(jìn)行相關(guān)性分析，我們推測(cè)，5701G>T位點(diǎn)的T等位基因與山羊的黑色表型有關(guān)或者是該位點(diǎn)與控制山羊黑色表型的位點(diǎn)存在連鎖關(guān)系。遺傳多樣性分析指標(biāo)表明，5701G>T位點(diǎn)在中國(guó)黑色山羊品種中的遺傳多樣性較低。群體遺傳分化分析結(jié)果表明，9個(gè)地方山羊群體間的遺傳分化系數(shù)僅為0.2615。聚類分析也基本符合毛色表型的分類，并且在不同的群體中，隨著

4、T等位基因頻率的升高，其成年體重降低，這可能是由于Agouti基因外顯子4中的5701G>T位點(diǎn)與山羊的生長(zhǎng)速度有關(guān)。 本研究同樣利用PCR-RFLP技術(shù)檢測(cè)了128delT缺失突變位點(diǎn)在國(guó)內(nèi)十個(gè)山羊品種中的多態(tài)性并與毛色進(jìn)行了相關(guān)性分析。結(jié)果表明，128delT缺失位點(diǎn)存在兩個(gè)等位基因A(缺失)和B(不缺失)，共產(chǎn)生三種基因型AA、AB和BB，其中AB基因型在白色山羊品種中占優(yōu)勢(shì)(76.14％)，從基因型在棕褐色山羊品種中頻率