植物葉綠體提取方法比較和兩種藥用植物葉綠體基因組分析.pdf

1、葉綠體作為植物細(xì)胞的重要細(xì)胞器，它自身完整的基因組研究在植物基因組學(xué)的研究中越來越重要。無患子（Sapindus mukorossi）和三葉青（Tetrastigmahemsleyanum Diels et Gilg）是兩種常用的藥用植物，具有重要的經(jīng)濟(jì)和藥用價(jià)值。目前關(guān)于無患子和三葉青葉綠體基因組的研究甚少，阻礙了這兩種藥用植物的分子生物學(xué)和基因組學(xué)的發(fā)展。本文首次發(fā)表了無患子和三葉青葉綠體基因組全長(zhǎng)，得到以下結(jié)果:
　　(1)

2、本論文首先對(duì)植物葉綠體分離方法進(jìn)行了比較分析，通過對(duì)比分離得到葉綠體的重量、質(zhì)量以及測(cè)序結(jié)果，最后得出結(jié)論:低鹽-高PH法得到的葉綠體最多，狀態(tài)最好，拼接最完全。
　　(2)運(yùn)用生物信息學(xué)的方法，拼接出無患子和三葉青的葉綠體基因組全長(zhǎng)，分別是160，481 bp和159，889 bp，并對(duì)兩種植物的葉綠體全基因組做了GC含量和重復(fù)序列分析。
　　(3)通過分析無患子和三葉青所在的無患子目和葡萄目各3種植物，發(fā)現(xiàn)葡萄目的3種植

3、物均丟失了IRa/LSC邊界上的rps19基因，且三葉青還丟失了SSC/IRa邊界的ycf1基因。無患子目和葡萄目的6種植物的基因編碼區(qū)比非編碼區(qū)保守，且IR區(qū)比LSC和IR區(qū)更趨保守。
　　(4)分別利用不同的數(shù)據(jù)源（rbcL、atpB、matK、rbcL+ atpB+ matK和53個(gè)蛋白編碼基因），構(gòu)建了41種薔薇分支的系統(tǒng)進(jìn)化樹，發(fā)現(xiàn)利用53個(gè)蛋白編碼區(qū)所得的系統(tǒng)進(jìn)化樹，科目位置準(zhǔn)確，且支持率高;而個(gè)別基因或者聯(lián)合建樹得到