蕓薹屬線粒體基因組比較分析及MSH1介導(dǎo)的葉片衰老研究.pdf

1、蕓薹屬（Brassica）包括重要的蔬菜作物和油料作物等?；诰€粒體比較基因組分析、基因組重組與MSH1介導(dǎo)的葉片衰老的研究，對解析蕓薹屬中異源多倍體演化與MSH1介導(dǎo)重要發(fā)育性狀具有重要意義。本研究以蕓薹屬作物為研究材料，取得以下主要結(jié)果:
　　1.通過高通量測序，組裝獲得長度為219919bp的和長度為232407bp的芥菜和黑芥線粒體基因組(NCBI編號:KJ461445、KP030753)。通過線粒體基因組注釋，在芥菜中，

2、有34個編碼蛋白質(zhì)的基因、20個編碼轉(zhuǎn)運RNA的基因、45個開放式閱讀框、3個編碼核糖體RNA的基因和一對長度為2427bp的長重復(fù)序列。在黑芥中，有33個編碼蛋白質(zhì)的基因、19個編碼轉(zhuǎn)運RNA的基因、41個開放式閱讀框、3個編碼核糖體RNA的基因和一對長度為6574bp的長重復(fù)序列。
　　2.通過對6種蕓薹屬線粒體共線性比對，發(fā)現(xiàn)二倍體的白菜、黑芥、甘藍(lán)與其各自相關(guān)的四倍體芥菜、埃塞爾比亞芥、甘藍(lán)型油菜具有較高的同源共線性。基于

3、11個已測序線粒體基因組主成分分析表明，11種線粒體基因組分為A,B，C三種基因組類型。黑芥和埃塞爾比亞芥代表B基因組。nap型油菜和botrytis型甘藍(lán)代表C基因組，三種芥菜、兩種captitata型甘藍(lán)、pol型油菜和白菜，聚類到混合組里，大部分是A基因組?；?1個已測序線粒體基因組系統(tǒng)進(jìn)化樹表明，11中線粒體基因組被分為3組。A組包括三種芥菜的基因型品種，pol型油菜和白菜，B組包括黑芥和埃塞爾比亞芥，C組包括三種甘藍(lán)和nap

4、型油菜?；诰€粒體基因組序列的蕓薹屬作物分化時間與已報道的基于核基因組計算的分化時間比較吻合。對6種蕓薹屬11個變種的線粒體進(jìn)行重復(fù)序列、編碼區(qū)域及線粒體基因組重組分析表明，親緣關(guān)系較近的物種具有相近數(shù)量的重復(fù)序列數(shù)和編碼區(qū)域基因數(shù)。
　　3.MSH1基因是調(diào)控線粒體基因組重組與葉綠體發(fā)育的關(guān)鍵基因，本研究探究了MSH1基因介導(dǎo)的葉片衰老。結(jié)果表明，葉片誘導(dǎo)衰老能導(dǎo)致MSH1基因下調(diào)表達(dá)，但是沒有檢測到明顯的線粒體基因組重組現(xiàn)象。