2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
已閱讀1頁,還剩74頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1、目的:研究L02/HBx細(xì)胞與L02/pcDNA3.0細(xì)胞的長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達(dá)譜,對差異基因進(jìn)行初步生物信息學(xué)分析。
  方法:選取實驗組L02/HBx,對照組轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒的L02細(xì)胞(L02/pcDNA3.0)作為實驗對象,分別提取兩組細(xì)胞的總RNA并純化,檢驗RNA質(zhì)量,反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,并合成生物素標(biāo)記的cRNA探針。利用lncRNA芯片技術(shù)檢測兩組的lncRNAs和mRNAs表達(dá)譜的差異,經(jīng)過對原始數(shù)據(jù)進(jìn)

2、行預(yù)處理、均一化后,篩選出差異表達(dá)的lncRNAs和mRNAs,進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。分別選取上調(diào)的lncRNA4個:TCONS_00006195, ENST00000557524, NR_037597,ENST00000539975,下調(diào)的lncRNA3個:ENST00000508424,ENST00000447433,uc0011va.4,采用SYBRGREENⅠ實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)在兩細(xì)胞株中驗證,并用GAPDH做內(nèi)

3、參。綜合NCBIRefSeq,UCSC,RNAdb,lncRNAs等數(shù)據(jù)庫資源,對芯片結(jié)果進(jìn)行GO,pathway初步生物信息學(xué)分析。
  結(jié)果:1.將實驗組和對照組lncRNAs表達(dá)量比較:其中2倍以上變化且差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的lncRNAs和mRNAs。與對照組比較,實驗組中l(wèi)ncRNA上調(diào)2倍以上變化的共323條,下調(diào)2倍以上變化的共421條;mRNA上調(diào)2倍以上變化的共742條,下調(diào)2倍以上變化的共501條。

4、
  2.采用SYBR綠色熒光染料Ⅰ(SYBRGREENⅠ)實時檢測的聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)驗證表達(dá)上調(diào)的4個lncRNAs: TCONS_00006195,ENST00000557524,NR_037597,ENST00000539975,表達(dá)下調(diào)的3個lncRNAs: ENST00000508424,ENST00000447433,uc0011va.4,和芯片結(jié)果基本吻合。
  3.GO(Gene Ontology

5、)分析顯示,在差異表達(dá)的mRNA中,上調(diào)表達(dá)的有526個參與生物學(xué)進(jìn)程,下調(diào)表達(dá)的680有個參與生物學(xué)進(jìn)程;上調(diào)表達(dá)的有68個參與細(xì)胞組件,下調(diào)表達(dá)的有59個參與細(xì)胞組件;上調(diào)表達(dá)的有77個參與分子功能,下調(diào)表達(dá)的有86個參與分子功能。
  4.Pathways分析顯示,在L02/HBx細(xì)胞中有52條通路(pathway)受上調(diào)的mRNAs調(diào)控,有21條通路受下調(diào)的mRNAs調(diào)控。
  結(jié)論:1.與對照組比較,L02/HBx

6、細(xì)胞株lncRNAs表達(dá)譜發(fā)生了顯著變化。其中RT-PCR驗證TCONS_00006195,ENST00000557524,NR_037597,ENST00000539975表達(dá)上調(diào),ENST00000508424,ENST00000447433,uc0011va.4表達(dá)下調(diào)。
  2.生物信息學(xué)初步分析L02/HBx細(xì)胞株中差異表達(dá)的mRNA涉及到L02/HBx細(xì)胞的生長、分化、凋亡以及整個細(xì)胞周期過程。涉及到的通路包括:信號傳

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論