基于SSR標記的大豆遺傳圖譜構建與重要農(nóng)藝性狀QTL定位.pdf

1、分子遺傳圖譜構建和重要農(nóng)藝性狀QTL分析是植物基因組學研究的主要內(nèi)容和基礎。大豆是重要的經(jīng)濟作物，但由于其為古源四倍體，基因組含有廣泛的復制區(qū)和豐富的重復序列，這使得其遺傳圖譜的研究落后于其他作物。SSR標記對來自不同群體的遺傳圖譜的整合起著關鍵作用。大豆基因組研究的一個重要內(nèi)容就是創(chuàng)建針對特定農(nóng)藝性狀進行定位的群體，并以之為材料平臺對重要農(nóng)藝性狀進行基因定位。 本研究以沈農(nóng)6號為母本、OhioFG1為父本雜交得到的92個F<,

2、7>代RIL群體為材料，構建了該群體基于SSR標記的大豆分子遺傳圖譜，并對頂端花序和短果枝性狀、產(chǎn)量相關性狀、蛋白質(zhì)和脂肪含量、植株生長性狀、莢粒性狀、葉片性狀、生育期結構性狀等30個性狀進行OTL定位分析，主要結果如下： 應用在沈農(nóng)6號×OhioFG1分離的170對SSR標記構建一張包含27個連鎖群的大豆遺傳圖譜?？傞L度為1745.5 cM，標記間平均間距為10.5 cM。每個連鎖群上的標記數(shù)在2～15個之間，長度在1.8～1

3、68.0 cM的范圍內(nèi)。SSR標記在本圖譜上分布較均勻，但也存在個別標記密集的區(qū)域，位于B2、D1b、D2＿1、F、K、N等連鎖群上。平均距離最大的連鎖群為M，為19.85 cM，最小的連鎖群為O＿1，為0.90 cM。在27個連鎖群中共有31個間距大于20 cM的標記區(qū)間，同時存在8個大的間隙。其中B2、D2、E、G、J、L、O連鎖群被分成2段，有待進一步添加標記。整體上，本圖譜在位置和順序上很好地符合公共遺傳圖譜。 利用所構

4、建的遺傳圖譜應用Windows QTL Cartographer V2.5采用復合區(qū)間作圖法對頂端花序、短果枝等30個大豆重要農(nóng)藝性狀進行了QTL定位。在LOD>2.0時共檢測到132個大豆農(nóng)藝性狀的QTL，分布在除D1a和O之外的18個連鎖群上，C1、C2、I、K、L、O連鎖群上的QTL位點較為密集。其中貢獻率大于10％的QTL為85個，貢獻率大于40％的QTL為11個。在兩年的試驗中均檢測到有關頂端花序和短果枝性狀的穩(wěn)定的主效QTL

5、，這兩個性狀緊密連鎖，均受主效QTL作用和微效QTL的修飾。與株高相關QTL qPH-l-2和與主莖節(jié)數(shù)相關QTL qSNN8l-2定位于L連鎖群上的同一區(qū)間，貢獻率分別為45.35％和52.83％，推測其為主效基因。控制生育期結構性狀的QTL集中分布在C2和O連鎖群上，其中有關始花期、始莢期、始粒期、始熟期和生育期的1個主效OTL位于C2連鎖群上同一位置(Satt100～Satt307)，表明這5個性狀可能由同一個基因或同一簇基因控制