肉牛脂代謝相關基因遺傳多態(tài)性及其與延邊牛肉質(zhì)性狀相關分析.pdf

1、本研究以魯西牛、南陽牛、延黃牛以及延邊牛4個品種肉牛群體共計356個體為材料，采用序列分析技術結合生物信息學方法，研究了影響牛脂肪代謝的MC4R、LEPR、HSL、LPL、SCD等5個候選基因部分基因座位的SNP位點，探討了試驗牛群的遺傳結構和遺傳多樣性;并對157頭延邊牛在上述位點的肉質(zhì)性狀指標進行了相關性分析，以期篩選出顯著影響肉牛肉質(zhì)性狀的功能基因或分子標記，為肉牛種質(zhì)資源保存與利用和延邊牛高效選育提供遺傳學依據(jù)。試驗得到以下主要

2、結果:
　　1、在HSL基因發(fā)現(xiàn)7處突變，四個試驗牛群體在1208bp、1537bp、1574bp、1729bp、1740bp、1869bp、與1921bp處的突變均處于中度多態(tài)和低度多態(tài)。其中，1729bpA→G的突變導致編碼蛋白的氨基酸由谷氨酰胺突變?yōu)榫彼幔?740bpT→C的突變導致絲氨酸突變?yōu)楦彼幔?869bpA→G的突變導致纈氨酸突變?yōu)楫惲涟彼幔?921bpA→G的突變導致谷氨酸突變?yōu)橘嚢彼帷?br>　　與延邊牛肉質(zhì)

3、性狀相關分析表明:1208bp A→C位點與眼肌面積、系水力、亮度、肉豆寇酸、油酸、亞油酸、亞麻酸、絲氨酸、甘氨酸、丙氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、賴氨酸呈顯著相關顯著相關;1537bpA→C位點與蒸煮損失、滴水損失、黃色度顯著相關;1729bp A→G位點與宰前活重、胴體重、背膘厚、肉豆寇酸、棕櫚酸、亞油酸、絲氨酸、精氨酸、賴氨酸顯著相關;1921bp A→G位點與宰前活重、胴體重、肉豆寇酸、亞油酸、亞麻酸、絲氨酸、甘氨酸、丙氨酸、異亮氨酸

4、、亮氨酸、脯氨酸、賴氨酸顯著相關。
　　2、在LPL基因329bp的A→T突變在延邊牛群體中處于中度多態(tài)，其余牛群體均處于低度多態(tài);該突變引起蘇氨酸突變?yōu)榻z氨酸，與延邊牛眼肌面積、蒸煮損失、滴水損失、PH、肉豆蔻酸、亞油酸、絲氨酸、甘氨酸、丙氨酸、賴氨酸顯著相關;
　　3、在LEPR基因2831bp的C→T突變在四個牛群體中均處于中度多態(tài)，使蘇氨酸突變?yōu)榈鞍彼?，引起了疏水性結構改變，導致蛋白質(zhì)二級結構在第940處左右出現(xiàn)一個

5、α螺旋丟失、β折疊增加，改變了三級結構中α螺旋、β轉角的空間位置，經(jīng)相關分析表明該位點與延邊牛背膘厚、眼肌面積、蒸煮損失顯著相關。
　　4、在MC4R基因1069bp發(fā)現(xiàn)C→G的突變在四個牛群體中屬于中度多態(tài)，引起亮氨酸突變?yōu)槔i氨酸，疏水性結構改變，導致蛋白質(zhì)二級結構在166、243、281處出現(xiàn)α螺旋丟失、β折疊丟失，三級結構中β轉角的空間位置發(fā)生改變。相關分析表明該位點與延邊牛背膘厚、亮度、黃色度、肉豆蔻酸、亞油酸及亞麻酸顯著

6、相關。
　　5、在SCD基因發(fā)現(xiàn)3處突變在四個牛群體中均處于中度多態(tài)。其中，1022bp處的突變使編碼蛋白的氨基酸由丙氨酸突變?yōu)槔i氨酸，導致了疏水性結構改變，表現(xiàn)為纈氨酸編碼蛋白的疏水性高于丙氨酸編碼蛋白的疏水性;引起蛋白質(zhì)二級結構在第291處出現(xiàn)α螺旋的丟失、無規(guī)則卷曲丟失，289處出現(xiàn)β折疊丟失，但蛋白質(zhì)三級結構沒有變化。相關分析表明846bp A→G的突變與延邊牛宰前活重、胴體重、背膘厚、硬脂酸、亞油酸、天冬氨酸、谷氨酸、甘