家蠶Bm1、BmSE轉(zhuǎn)座子對基因表達(dá)調(diào)控的研究.pdf

1、反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子作為基因表達(dá)的調(diào)控元件，對生物體基因組的進(jìn)化有著非.常重要的作用。而在家蠶中，Bm1和BmSE轉(zhuǎn)座子是最主要的兩類短散列轉(zhuǎn)座子（Short interspersed Nuclear Elements，SINE）轉(zhuǎn)座子，其對基因表達(dá)的調(diào)控模式及其分子機(jī)制仍然不清楚。本文以綠.色熒光蛋白（Enhan.ced Green Fluores.cent Protein，EG.FP）基因為報告基因，考察和驗證了Bm1和BmSE轉(zhuǎn)座子對臨近

2、基因的調(diào)控模式，同時探究了轉(zhuǎn)座子調(diào)控基因表達(dá)的分子機(jī)制。主要結(jié)果如下：
　?、貰m1和BmSE轉(zhuǎn)座子對臨近基因的表達(dá)具有相同的調(diào)控模式：在基因上游的插入會導(dǎo)致基因表達(dá)的沉默，在基因下游的插入則不會沉默或者抑制基因的表達(dá)。而同時，這種調(diào)控模式具有跨細(xì)胞類型通用的性質(zhì)，不僅在家蠶BmN細(xì)胞中發(fā)揮作用，在家蠶BmE細(xì)胞中也有同樣的調(diào)控效應(yīng)，說明這種調(diào)控機(jī)制是保守性的。
　?、贐m1和BmSE轉(zhuǎn)座子沉默基因的表達(dá)需要滿足三個條件。1

3、）位置特異性：Bm1和BmSE轉(zhuǎn)座子僅在插入到EGFP基因上游時，才具有抑制作用；2）序列完整性：只有Bm1和BmSE轉(zhuǎn)座子具有完整的序列，才能夠保證抑制調(diào)控，任何破壞序列完整的處理，如截短、堿基突變都會解除沉默效應(yīng)；3）方向正向性：Bm1和BmSE轉(zhuǎn)座子的沉默效應(yīng)要求兩類轉(zhuǎn)座子正向的插入。
　?、跙m1和BmSE轉(zhuǎn)座子沉默基因的表達(dá)并不是在轉(zhuǎn)錄水平上發(fā)揮作用的，轉(zhuǎn)座子啟動子化、轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前移均未發(fā)生，同時轉(zhuǎn)座子的二級結(jié)構(gòu)改變也

4、并不是影響基因表達(dá)的主要原因。
　?、芡ㄟ^生物信息學(xué)分析，我們得到了Bm1轉(zhuǎn)座子和BmSE轉(zhuǎn)座子在家蠶基因組中的分布，5’ UTR區(qū)域具有Bm1轉(zhuǎn)座子和BmSE轉(zhuǎn)座子正向插入的預(yù)測基因分別有125個和58個。
　?、萃瑫r根據(jù)8個家蠶和7個野桑蠶基因組重測序數(shù)據(jù)分析了Bm1和BmSE轉(zhuǎn)座子分別在家野蠶基因組中相應(yīng)位點(diǎn)的插入頻率，插入頻率有明顯差異的位點(diǎn)共有51個，為理解家蠶馴化過程中轉(zhuǎn)座子的可能作用提供了有用信息。