毛竹HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族基因的鑒定及PeHDZ45的克隆與分子特征分析.pdf

1、毛竹是竹類植物中應(yīng)用最廣泛的一類，也在安徽省農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)中占據(jù)重要地位。然而安徽冬秋季節(jié)性干旱氣候?qū)γ裆L的影響越來越顯著，毛竹的干旱問題日益突出。植物HD-ZipⅠ蛋白是一類重要的參與干旱等非生物逆境響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄因子家族，在擬南芥、水稻、玉米等物種中已經(jīng)分離并驗證了一系列抗旱相關(guān)基因，但是在目前有關(guān)毛竹抗旱的研究工作當(dāng)中，還沒有涉及到HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子。本研究中，我們首先利用基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化以及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)等生物信息學(xué)手段對毛竹全基因組HD

2、-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族基因進(jìn)行了詳細(xì)地分析，然后通過對毛竹進(jìn)行模擬干旱環(huán)境處理，分析從毛竹葉片中提取的HD-ZipⅠ轉(zhuǎn)錄因子的誘導(dǎo)表達(dá)模式，根據(jù)實驗結(jié)果篩選出PeHDZ45基因。隨后從毛竹中克隆出PeHDZ45。對PeHDZ45的分子序列特征進(jìn)行分析，包括序列特征、組織表達(dá)模式、亞細(xì)胞定位和轉(zhuǎn)錄活性的分析。本研究主要獲得以下結(jié)果:
　　1.從毛竹基因組數(shù)據(jù)庫中鑒定出48個HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子。對這48個基因進(jìn)行了結(jié)構(gòu)以及進(jìn)化分析。結(jié)

3、果顯示，毛竹HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子分成四個亞家族，各家族成員之間序列高度保守，且與其他典型禾本科單子葉植物（水稻、玉米和高粱）結(jié)構(gòu)類似。
　　2.從基因序列與結(jié)構(gòu)分析中我們發(fā)現(xiàn)，所有毛竹HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子均含有相當(dāng)保守的HD和Zip結(jié)構(gòu)域。
　　3.從毛竹中克隆得到抗旱候選基因PeHDZ45，基因序列分析得出PeHDZ45全長696bp，共編碼231個氨基酸。組織表達(dá)模式結(jié)果顯示，相比較于毛竹其他幾種組織，PeHDZ45在毛