N-乙?；富蚨鄳B(tài)性及其結(jié)構(gòu)和功能研究.pdf

1、無(wú)論是藥物代謝酶還是藥物作用受體，其本質(zhì)均為蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)的功能是由其空間結(jié)構(gòu)決定的。藥物代謝酶、轉(zhuǎn)運(yùn)體等存在著基因多態(tài)性與藥物療效和毒性的相關(guān)性問(wèn)題，因而可以認(rèn)為藥效及毒性的個(gè)體間遺傳差異都是由各種cSNPs經(jīng)轉(zhuǎn)錄翻譯產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)差異造成的。N-乙?；?(NAT2)表達(dá)于人體的肝臟和腸道，在體內(nèi)參與20多種肼類化合物及致癌性芳香胺和雜環(huán)胺類化合物的生物激活或滅活代謝，同時(shí)與某些癌癥的遺傳易感性有關(guān)。因此，近年來(lái)NAT2在藥物代謝方面的

2、作用正受到越來(lái)越多的重視。本課題的目的是建立快速、準(zhǔn)確檢測(cè)NAT2基因多態(tài)性的方法，研究中國(guó)人NAT2基因型的分布，借助計(jì)算機(jī)模擬技術(shù)獲得NAT2的三維模型，通過(guò)結(jié)構(gòu)分析，研究相關(guān)功能，探索其基因多態(tài)性對(duì)結(jié)構(gòu)和功能的影響，進(jìn)一步從分子水平解釋基因多態(tài)性造成藥物代謝的個(gè)體差異，有助于進(jìn)行相關(guān)藥物的設(shè)計(jì)，指導(dǎo)臨床合理使用相關(guān)藥物。 第一部分：兩步PCR-RFLP法檢測(cè)中國(guó)人N-乙?；富蛐?中國(guó)人群中NAT2的基因型主要有

3、野生型(*4)、突變型(*5、*6、*7)，NAT2的代謝類型主要分為快代謝(EM)和慢代謝(PM)，慢代謝主要與*5、*6、*7三種等位基因有關(guān)。本部分主要是建立一種新的快速方便的PCR-RFLP法檢測(cè)NAT2的多態(tài)性，并研究NAT2基因型在中國(guó)人群中的分布頻率。對(duì)來(lái)自十八個(gè)省市的150名中國(guó)健康人NAT2基因類型進(jìn)行分析，用改進(jìn)的酚/氯仿抽提法提取細(xì)胞中的DNA，經(jīng)PCR擴(kuò)增NAT2全長(zhǎng)后，在一定的反應(yīng)體系中分兩步加入內(nèi)切酶KpnⅠ

4、、BamHⅠ和TaqⅠ，得到的片段以電泳檢查結(jié)果，同時(shí)用等位基因特異擴(kuò)增法(ASA)方法檢測(cè)其中20％的樣本，用Hardy-Weinberg平衡計(jì)算NAT2基因型的分布頻率。結(jié)果顯示兩步PCR-RFLP法與ASA法結(jié)果完全一致。中國(guó)人野生型*4和*5、*6、*7三種突變型等位基因的基因頻率分別為63％、4.3％、18.3％和14.3％，符合Hardy-Weinberg平衡(x2=7.89，v=9，0.7＞P＞0.5)。本試驗(yàn)通過(guò)對(duì)原有P

5、CR-RFLP法進(jìn)行改進(jìn)，達(dá)到快速、簡(jiǎn)便地檢測(cè)NAT2基因型的目的，并且與等位基因特異性擴(kuò)增法的檢測(cè)結(jié)果一致，能準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)中國(guó)人NAT2慢代謝，可以用于臨床檢測(cè)。 第二部分：N-乙?；傅慕Y(jié)構(gòu)模擬、功能分析和其基因多態(tài)性對(duì)活性的影響 在已知用X射線衍射法得到SalmonellatyphimuriumNAT(StNAT)晶體結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，對(duì)人類NAT1、NAT2和StNAT的氨基酸序列進(jìn)行多重序列比對(duì)，二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，折疊識(shí)

6、別，并采用同源模擬SWISS-MODEL服務(wù)器，以StNAT為模板，對(duì)人類NAT2(residues29±131)進(jìn)行同源結(jié)構(gòu)模擬，用Swiss-PdbViewer對(duì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行進(jìn)一步的分析，將模板蛋白和目標(biāo)蛋白的結(jié)構(gòu)進(jìn)行比對(duì)，重點(diǎn)分析活性位點(diǎn)及相關(guān)部分，與模板蛋白結(jié)構(gòu)比較的同時(shí)根據(jù)結(jié)構(gòu)特征對(duì)其功能進(jìn)行分析，并對(duì)其蛋白功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)以及活性位點(diǎn)進(jìn)行研究。在此基礎(chǔ)上對(duì)NAT2基因突變(G191→A)引起的氨基酸突變(Arg64→Gln)，進(jìn)行

7、模擬分析，研究突變?cè)斐稍拥慕嵌群途嚯x等結(jié)構(gòu)的變化，探索其引起催化活性變化的機(jī)制，從分子水平解釋基因多態(tài)性造成藥物代謝的個(gè)體差異。同源模擬的結(jié)構(gòu)模型用PROCHECK進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)合以上結(jié)果，對(duì)NAT2的催化結(jié)構(gòu)域、活性位點(diǎn)、構(gòu)象穩(wěn)定性進(jìn)行分析，預(yù)測(cè)其如何進(jìn)行底物的選擇和乙?；^(guò)程。結(jié)果表明，NAT2催化功能必要條件的高度保守的半胱氨酸殘基(與Cys68對(duì)應(yīng))，高度保守的殘基Arg64對(duì)NAT2的構(gòu)象穩(wěn)定性有貢獻(xiàn)，對(duì)應(yīng)于NAT2結(jié)構(gòu)中(C

8、ys68,His107,Asp122)三個(gè)關(guān)鍵殘基作為類半胱氨酸蛋白酶催化三元組聯(lián)合發(fā)揮催化作用，比較stNAT和NAT2活性部位的結(jié)構(gòu)元件發(fā)現(xiàn)，二者均含有參與催化中心構(gòu)成的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。既往研究顯示，該環(huán)狀結(jié)構(gòu)中的某些氨基酸殘基參與結(jié)合輔酶A及對(duì)芳香胺底物的選擇性。這些殘基包括125位氨基酸(NAT2中125位絲氨酸)，該氨基酸被認(rèn)為參與對(duì)底物的識(shí)別過(guò)程，從NAT2的結(jié)構(gòu)分析得到了對(duì)上述結(jié)論直觀和合理的解釋。評(píng)價(jià)結(jié)果表明同源模擬建立的NA