虹彩病毒microRNA的鑒定.pdf

1、MicroRNA(miRNA)是一類內(nèi)源性的小分子非編碼RNA(non-codingRNA，ncRNA)，它們?cè)谏锷L發(fā)育、細(xì)胞分裂、細(xì)胞凋亡以及癌變等關(guān)鍵階段的基因表達(dá)調(diào)控中扮演著十分重要的角色。在真核生物，miRNA的機(jī)構(gòu)與功能都表現(xiàn)出很高的進(jìn)化保守性，迄今，在線蟲、果蠅、人和植物等多種生物中的miRNA已超過數(shù)千種。最近，研究人員發(fā)現(xiàn)病毒中存在許多miRNA，其中多數(shù)是從其雙鏈DNA基因組轉(zhuǎn)錄形成的。其中，研究人員除了對(duì)皰疹病毒

2、(herpesviruses)，多瘤病毒(polyomaviruses)和逆轉(zhuǎn)錄病毒(retroviruses)三種病毒家族編碼的miRNAs的功能有所了解之外，對(duì)其余miRNA的功能尚不清楚。另外，很多病毒編碼的miRNA都有非常特別的發(fā)生和功能特性，例如，miRNA形成時(shí)所利用的轉(zhuǎn)錄聚合酶的種類以及miRNA在前體中的位置等；病毒感染時(shí)與宿主miRNA的相互作用等，這些事實(shí)也暗示病毒miRNA可能具有某些特殊的功能。 虹彩病

3、毒(Iridoviridae)是一類具有二十面立體對(duì)稱衣殼結(jié)構(gòu)的大型胞漿型雙鏈DNA病毒。由于虹彩病毒家族中很多成員被證實(shí)可以引起魚類、蛙類和龜類等水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物的病害并導(dǎo)致高致死率，虹彩病毒逐漸受到研究人員的關(guān)注。虹彩病毒科下設(shè)五個(gè)屬，有十株病毒已被全基因組測(cè)序。 本論文針對(duì)于十株具有全基因組序列信息的虹彩病毒miRNA進(jìn)行了預(yù)測(cè)與鑒定工作。為了準(zhǔn)確查找病毒基因組編碼的miRNA前體，同時(shí)最大限度地降低由生物信息學(xué)本身特征所引起