黃杉屬的分子系統(tǒng)發(fā)育與生物地理學(xué).pdf

1、松科植物的葉綠體和線粒體基因分別為父系和母系遺傳，二者的聯(lián)合分析為系統(tǒng)發(fā)育重建，特別是揭示網(wǎng)狀進(jìn)化過(guò)程提供了便利條件。此外，松科中的多個(gè)屬(如黃杉屬、鐵杉屬等)呈洲際間斷分布，是研究生物地理學(xué)問(wèn)題的良好試材。
　　 本文選擇來(lái)自于葉綠體和線粒體基因組的5個(gè)DNA片段，通過(guò)序列分析對(duì)黃杉屬的所有8個(gè)種進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育重建；同時(shí)結(jié)合已有的對(duì)黃杉屬的各方面研究，討論了該屬典型的東亞-北美間斷分布式樣的形成過(guò)程。主要結(jié)果如下：
　　

2、 (1)葉綠體DNA片段trnfM-trnS、rpl20和trnP的序列分析
　　 無(wú)論葉綠體基因兩兩組合分析還是3個(gè)葉綠體片段的聯(lián)合分析均強(qiáng)烈支持東亞的6種黃杉屬植物聚為一支(支持率＞96％)，其中日本黃杉位于最基部，其他分布于中國(guó)的5個(gè)種聚在一起。
　　 (2)線粒體基因nad5和cox1的序列分析
　　 線粒體基因序列的進(jìn)化速率較慢，信息位點(diǎn)相對(duì)較少，因此分辨率較低。本文中線粒體DNA序列在黃杉屬的東亞物

3、種間幾乎沒有分辨率，但是仍以＞60％的Bootstrap支持率將該屬分為東亞與北美兩個(gè)姐妹支。
　　 (3)5個(gè)DNA片段的聯(lián)合分析
　　 5個(gè)細(xì)胞質(zhì)DNA片段(trnfM-trnS，rpl20，trnP，nad5，cox1)的聯(lián)合數(shù)據(jù)矩陣長(zhǎng)4351 bp，其中含變異位點(diǎn)129個(gè)(3.0％)，信息位點(diǎn)109個(gè)(2.5％)。利用最大簡(jiǎn)約法進(jìn)行的系統(tǒng)發(fā)育分析表明：黃杉屬分成北美和東亞兩支，與地理分布相吻合，并分別得到了66％