水稻胚乳及幼苗基因表達譜的研究.pdf

1、真核生物基因組龐大,其中僅有的2-3﹪的序列編碼基因,如人的基因組由31.647億bp組成,約有2﹪的序列編碼3.3萬個基固(Venter等,2001);水稻基因組為4.2億bp,編碼約3-5萬個基因(Goff等,2002).直接從如此龐大的基因組中研究基因,相當費時費力.并且確定幾萬個基因的表達模式及相互間的關系,如果按照傳統(tǒng)的逐個基因進行的方法,幾乎是不可能完成的工作.表達序列標簽(expressed sequence tag,ES

2、T)技術就是基于這種認識而發(fā)展起來的.EST是cDNA的部分序列,長度一般為300~500bp,由大規(guī)模cDNA克隆一次測序得到.由于cDNA的5'端或3'端的有限序列可特異地代表一個基因,故被稱為"表達序列標簽"(Adams等,1991).EST技術已成為發(fā)現(xiàn)新基因和基因表達譜研究的有效工具,受到全世界許多實驗室的重視.就水稻而言,1999年12月,NCBI(National Center for Biotechnology Info

3、rmation)的dbEST數(shù)據(jù)庫(www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/dbEST_summary.html)中有47449條水稻EST,至水稻基因組工作草圖公布之時,已達到104,000條(Goff等,2002).DNA測序技術的革命大大降低了測序成本,對cDNA文庫的大規(guī)模隨機測序已經(jīng)成為一項實用技術.測序所得的成千上萬的EST序列不僅可供研究人員以較低的費用快速克隆目的新基因,而且可提供豐富的基因表達信息,對于研