蠶豆EST-SSR分子標(biāo)記的建立及其應(yīng)用.pdf

1、蠶豆是世界上重要的豆科植物之一,是人類飲食中淀粉和蛋白質(zhì)的重要來源,中國(guó)和歐洲是蠶豆主要的生產(chǎn)地。由于其部分交叉授粉,蠶豆具有高度異質(zhì)性,因此品種間以及地方品種間包含了廣泛的遺傳變異,使保護(hù)種質(zhì)資源變得更加昂貴和困難。盡管其種植歷史悠久并且有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,但是對(duì)蠶豆分子標(biāo)記仍然稀少。因此,在發(fā)展蠶豆更可靠更有效的分子標(biāo)記將在多樣性分析和資源保護(hù)中起重要作用。
　　 EST-SSR分子標(biāo)記在植物遺傳分析和育種研究中已成為一個(gè)有力

2、的工具。由于它從轉(zhuǎn)錄本推導(dǎo),這些標(biāo)記基因的SSR標(biāo)記比傳統(tǒng)的分子標(biāo)記占有優(yōu)勢(shì):EST-SSR分子標(biāo)記的開發(fā)更簡(jiǎn)捷更廉價(jià),相關(guān)物種具有較高的通用性,并更緊密地連接已知功能基因。
　　 我們下載了NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中公布的蠶豆5031條EST序列,通過對(duì)5031條EST序列進(jìn)行拼接,得到Unigene1148條,通過SSR搜索軟件搜索到107個(gè)SSR位點(diǎn),SSRs的出現(xiàn)頻率為9.32％。其中三核苷酸在107個(gè)SSR重復(fù)序列中是最為豐富的

3、重復(fù)類型,占44.86％。而在三核苷酸中AAG是最豐富的重復(fù)基元,占有12.5％。AG和TC是二核苷酸中最豐富的,各占33％。其它SSR重復(fù)類型所占比例相差不大。我們首次分離和鑒定了11個(gè)蠶豆EST-SSR分子標(biāo)記其等位基因變異數(shù)為每個(gè)位點(diǎn)2-3,各多態(tài)性引物的PIC值變化范圍為0.06到0.43,平均PIC值為0.2919。在此基礎(chǔ)上,我們利用已開發(fā)的11個(gè)EST-SSR分子標(biāo)記對(duì)來自中國(guó)和歐洲的29個(gè)品種進(jìn)行主成分分析和聚類分析,結(jié)